Ähnlichkeitsvergleich von Nucleotid- oder Aminosäuresequenzen durch gegenseitige Ausrichtung der verglichenen Sequenzen bis zur optimalen Übereinstimmung. (Quelle: Berg, J.M., Tymoczko, J.L. und Stryer L. (2013). Biochemie. Springer Verlag, 7. Auflage, Seite 180-184)